金剛薩埵百字明咒是尊指第六金剛持的咒，是密教很重視、很偉大的一個咒，平時或在修法的時候，都應該誦這個咒語，是修持大圓滿法時很重要的咒。
金剛薩埵百字明咒有三個很大的功用
一、做懺悔。
金剛薩埵百字明咒是屬於空性的，持此咒可歸於空性，也是懺悔所有的業障。
二、誦持此咒時，可以獲得五大金剛持與第六金剛持所有的金剛持尊者的加持。
三、圓滿。
金剛薩埵百字明咒是最圓滿的咒語，既然是最圓滿的，你在修法的時候，有什麼缺點遺漏，或是禮節上不夠、有妄念雜念時，唸百字明咒可把錯漏的地方全部變成圓滿。
所以金剛薩埵百字明咒可說是一種補咒!